主辦單位：深圳市華大基因學院
舉辦地點：中國 深圳?
培訓時間：2016年12月19日-12月23日
1
培訓目標
? ?了解轉錄組學最新進展，主流前沿研究思路
???掌握轉錄組常用分析軟件的使用方法和分析要點
? ?轉錄組項目設計和執行過程中遇到的實際問題，加快成果轉化
?用R掌握常規數據處理、統計分析方法
?提供有針對性的R繪圖指導、能夠運用R繪圖工具實現發表文章所需圖形的繪制
2
培訓優勢
3
培訓特色
一流的講師團隊——豐富的軟件研發經驗、重大項目執行經驗
全面的課程——技術原理、分析流程、技術應用相互結合
實用軟件——從工作中的實際需要出發，精心挑選相應軟件上機實操
VIP增值服務——培訓后期贈送R語言繪圖在線學習課程
面對面解決問題——與專家面對面探討項目中的瓶頸問題
4
培訓對象
1. 從事生命科學、農學、醫學等領域科研工作者和高校教師及研究生 ；?
2.?迫切希望提升轉錄組&蛋白質組生物信息分析能力的學者?。
5
培訓內容
模塊 | 時間 | 課程 | 時 長 | 形 式 |
選修一 3600元/人 | 2016/12/19 | 1. RNA-seq進展及熱點介紹 | 1h | 理論 |
2. denovo和定量分析介紹 | 6h | 理論? + 實操 | ||
2.1 denovo組裝 | ||||
2.2 unigene注釋 | ||||
2.3?表達定量分析 | ||||
2.4?差異表達基因篩選 | ||||
2.5?顯著性富集分析 | ||||
2.6?案例解析 | ||||
3.?上機實踐 | ||||
3.1 Blast2GO、WEGO介紹 | ||||
3.2?顯著性富集分析（DAVID、KO2BAS） | ||||
3.3?聚類分析（Cluster、treeview、Genesis） | ||||
3.4 GSEA介紹 | ||||
2016/12/20 | 4.?全轉錄組分析介紹 | 7h | 理論? + 實操 | |
4.1?基本數據處理 | ||||
4.2?數據比對和統計分析 | ||||
4.3?點突變檢測：SNP、SNV分析 | ||||
4.4?點突變檢測：RNA編輯 | ||||
4.5?結構變異檢測：可變剪切 | ||||
4.6?結構變異檢測：基因融合 | ||||
4.7 lncRNA分析介紹 | ||||
4.8?案例解析 | ||||
5?上機實踐 | ||||
5.1 IGV可視化介紹 | ||||
5.2?時間序列分析 | ||||
2016/12/21 | 6.?非編碼RNA分析介紹 | 7h | 理論? + 實操 | |
6.1?小RNA分類注釋 | ||||
6.2?預測新的miRNA | ||||
6.3?靶基因預測 | ||||
6.4?靶基因功能富集 | ||||
6.5?互作調控分析（miRNA和mRNA、IncRNA） | ||||
7.?上機實踐 | ||||
7.1?靶基因預測（psRNATarget、micro-T） | ||||
7.2?可視化工具介紹（RNAstructure、Cytoscape） | ||||
7.3?案例解析 | ||||
選修二 3600元/人 | 2016/12/22 | 1. R語言簡介、功能及基本語法介紹 | 4h | 理論 |
1.1 R及RStudio軟件的安裝、運行及使用 | ||||
1.2 R語法介紹（R基本符號，數據結構，程序設計） | ||||
1.3?上機實操 | ||||
2.?數據處理功能及統計應用 | 4h | 理論 + 實操 | ||
2.1?數據的讀取與存儲 | ||||
2.2?字符及字符串操作 | ||||
2.3?數據處理 | ||||
2.4?統計分析 | ||||
2016/12/2 | 3. R語言的繪圖功能及應用案例 | 7h | 理論 + 實操 | |
3.1?基礎繪圖工具（繪圖函數、參數、畫圖面板分割及圖形的保存） | ||||
3.2?圖形案例實際制作 | ||||
A、散點圖——點線混合圖、并列散點圖、坐標對數化 B、條形圖——標準條形圖、推積條形圖、鄰接條形圖、Error Bar形圖 C、文氏圖 D、餅圖——二維餅圖、三維餅圖 E、經驗分布 F、盒形圖(箱線圖)? G、頻率直方圖 H、QQ圖 I、熱圖（三種熱圖不同作圖方法） J、多組圖 K、其它圖形包（gplots、ggplot2?、lattice） | ||||
贈送線上課程（鞏固學習） | R語言繪圖在線學習課程 | 一年有效觀看時間 | ||
6
繪圖示例
7
講師團隊
我們的講師來自工作一線，項目經驗豐富，多次參與重大項目和論文撰寫，有開發生物信息學軟件的寶貴實戰經驗，對生物信息學有全面了解和深刻認識。每個專題主講一人，老師配備助教，同時指導項目討論及輔導實踐上機。
石明明：泛亞太疾病研究部，疾病研究方向。
朱欠華：高級項目負責人，從事生物信息分析6年，主要擅于轉錄組和重測序分析，包括表達定量、非編碼RNA調控、基因共表達網絡以及變異檢測等。參與多個合作項目（部分文章已發表），主要負責其中的信息分析工作。
聞博：華大學院生物信息繪圖首席專家；2010年畢業于華中科技大學生物信息技術專業后進入BGI，華大基因研究院蛋白質組學研究專家，有著豐富的生物信息分析經驗和項目經驗。教學經驗也很豐富，舉一反三。
優惠政策
1. 選修一和選修二的培訓費分別是3600元/人，同時選擇所有選修課程可以享受600元優惠，全選優惠價6600元/人；
2. 凡華大基因長期業務合作伙伴和華大基因生物信息學培訓班老學員，單選課程可享受9.5折優惠；
3. 4+1團體優惠，即同一單位有4人同時報名參加該期培訓班，可額外免費贈送1個名額（只限于同一期培訓班）。
（以上三項優惠政策不能同時享用）
歡迎報名
1. 報名鏈接：https://www.wenjuan.com/s/E3EbYf/?（點擊文末“閱讀原文”即可立即報名）
2. 聯系電話：0755-36352044 黃老師、鄭老師
3.?報名郵箱：training@service.genomics.cn
4. 官方網站：www.x-omics.org
基因科技造福人類
長按二維碼識別關注我們