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      開班啦!生物信息學研討系列——轉錄組&R語言繪圖技能研討班

      2020-11-20 09:12:47 華大基因


      轉錄組&R語言繪圖技能研討班

      應廣大學員需求,華大基因學院集結轉錄組分析、R語言繪圖領域專家,將華大在各項目執行過程中所積累的寶貴經驗,沉淀為經典課程呈現給各位同仁。?


      主辦單位:深圳市華大基因學院

      舉辦地點:中國 深圳?

      培訓時間:2016年12月19日-12月23日




      1

      培訓目標

      ? ?了解轉錄組學最新進展,主流前沿研究思路

      ???掌握轉錄組常用分析軟件的使用方法和分析要點

      ? ?轉錄組項目設計和執行過程中遇到的實際問題,加快成果轉化

      ?用R掌握常規數據處理、統計分析方法

      ?提供有針對性的R繪圖指導、能夠運用R繪圖工具實現發表文章所需圖形的繪制


      2

      培訓優勢

      滿足你的獨立動手能力、獨立解決問題能力,讓你學會如何將所學知識應用到實際研究中,學習到書本知識與實際應用中的差異,從而了解并獲得更多的項目經驗。


      3

      培訓特色

      1. 一流的講師團隊——豐富的軟件研發經驗、重大項目執行經驗

      2. 全面的課程——技術原理、分析流程、技術應用相互結合

      3. 實用軟件——從工作中的實際需要出發,精心挑選相應軟件上機實操

      4. VIP增值服務——培訓后期贈送R語言繪圖在線學習課程

      5. 面對面解決問題——與專家面對面探討項目中的瓶頸問題


      4

      培訓對象

      1. 從事生命科學、農學、醫學等領域科研工作者和高校教師及研究生 ;?

      2.?迫切希望提升轉錄組&蛋白質組生物信息分析能力的學者?。


      5

      培訓內容

      模塊

      時間

      課程

      時 長

      形 式

      選修一

      3600/

      2016/12/19
      ?
      (星期一)

      1. RNA-seq進展及熱點介紹

      1h

      理論

      2. denovo和定量分析介紹

      6h

      理論?

      +

      實操

      2.1 denovo組裝

      2.2 unigene注釋

      2.3?表達定量分析

      2.4?差異表達基因篩選

      2.5?顯著性富集分析

      2.6?案例解析

      3.?上機實踐

      3.1 Blast2GO、WEGO介紹

      3.2?顯著性富集分析(DAVID、KO2BAS

      3.3?聚類分析(Cluster、treeview、Genesis

      3.4 GSEA介紹

      2016/12/20
      ?
      (星期二)

      4.?全轉錄組分析介紹

      7h

      理論?

      +

      實操

      4.1?基本數據處理

      4.2?數據比對和統計分析

      4.3?點突變檢測:SNP、SNV分析

      4.4?點突變檢測:RNA編輯

      4.5?結構變異檢測:可變剪切

      4.6?結構變異檢測:基因融合

      4.7 lncRNA分析介紹

      4.8?案例解析

      5?上機實踐

      5.1 IGV可視化介紹

      5.2?時間序列分析

      2016/12/21
      ?
      (星期三)

      6.?非編碼RNA分析介紹

      7h

      理論?

      +

      實操

      6.1?RNA分類注釋

      6.2?預測新的miRNA

      6.3?靶基因預測

      6.4?靶基因功能富集

      6.5?互作調控分析(miRNAmRNA、IncRNA

      7.?上機實踐

      7.1?靶基因預測(psRNATarget、micro-T

      7.2?可視化工具介紹(RNAstructure、Cytoscape

      7.3?案例解析

      選修二

      3600/

      2016/12/22
      ?
      (星期四)

      1. R語言簡介、功能及基本語法介紹

      4h

      理論

      1.1 RRStudio軟件的安裝、運行及使用

      1.2 R語法介紹(R基本符號,數據結構,程序設計)

      1.3?上機實操

      2.?數據處理功能及統計應用

      4h

      理論

      +

      實操

      2.1?數據的讀取與存儲

      2.2?字符及字符串操作

      2.3?數據處理

      2.4?統計分析

      2016/12/2
      ?
      (星期五)

      3. R語言的繪圖功能及應用案例

      7h

      理論

      +

      實操

      3.1?基礎繪圖工具(繪圖函數、參數、畫圖面板分割及圖形的保存)

      3.2?圖形案例實際制作

      A、散點圖——點線混合圖、并列散點圖、坐標對數化

      B、條形圖——標準條形圖、推積條形圖、鄰接條形圖、Error Bar形圖

      C、文氏圖

      D、餅圖——二維餅圖、三維餅圖

      E、經驗分布

      F、盒形圖(箱線圖)?

      G、頻率直方圖

      H、QQ

      I、熱圖(三種熱圖不同作圖方法)

      J、多組圖

      K、其它圖形包(gplots、ggplot2?、lattice

      贈送線上課程(鞏固學習)

      R語言繪圖在線學習課程

      一年有效觀看時間


      【注】:深圳華大基因學院保留對以上課程信息(包括主題、課程安排和其他細節)進行調整的權利,具體課程信息以實際上課為準。


      6

      繪圖示例



      7

      講師團隊

      我們的講師來自工作一線,項目經驗豐富,多次參與重大項目和論文撰寫,有開發生物信息學軟件的寶貴實戰經驗,對生物信息學有全面了解和深刻認識。每個專題主講一人,老師配備助教,同時指導項目討論及輔導實踐上機。


      石明明:泛亞太疾病研究部,疾病研究方向。


      朱欠華:高級項目負責人,從事生物信息分析6年,主要擅于轉錄組和重測序分析,包括表達定量、非編碼RNA調控、基因共表達網絡以及變異檢測等。參與多個合作項目(部分文章已發表),主要負責其中的信息分析工作。


      聞博:華大學院生物信息繪圖首席專家;2010年畢業于華中科技大學生物信息技術專業后進入BGI,華大基因研究院蛋白質組學研究專家,有著豐富的生物信息分析經驗和項目經驗。教學經驗也很豐富,舉一反三。


      優惠政策

      1. 選修一和選修二的培訓費分別是3600元/人,同時選擇所有選修課程可以享受600元優惠,全選優惠價6600元/人;

      2. 凡華大基因長期業務合作伙伴和華大基因生物信息學培訓班老學員,單選課程可享受9.5折優惠;

      3. 4+1團體優惠,即同一單位有4人同時報名參加該期培訓班,可額外免費贈送1個名額(只限于同一期培訓班)。

      (以上三項優惠政策不能同時享用)


      歡迎報名

      1. 報名鏈接:https://www.wenjuan.com/s/E3EbYf/?(點擊文末“閱讀原文”即可立即報名)

      2. 聯系電話:0755-36352044 黃老師、鄭老師

      3.?報名郵箱:training@service.genomics.cn

      4. 官方網站:www.x-omics.org





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